欧盟委员会关于在2021-2030年期间重新制定可再生能源指令（RED II）的提议包括将6.8％的可再生能源目标用于交通运输。可以通过先进的生物燃料，可再生电力，废物基化石燃料和非生物来源的可再生燃料（例如动力到液体）来实现此目标。以食物为基础的生物燃料不适合用于运输目标。该提案定义了可用于生产高级生物燃料的合格原料清单，包括许多通常称为“废物”和“残渣”的材料类型，例如市政废物，麦秸，林业残留物和不可食用的动物脂肪。

替代燃料必须将温室气体（GHG）排放量至少减少70％才有资格，但委员会提议的温室气体计算方法不包括间接影响。据估计，间接土地利用变化（ILUC）将大大减少，并在某些情况下消除与粮食制成的生物燃料（例如玉米乙醇和菜籽生物柴油）相关的温室气体节省。RED II提案中由合格的先进生物燃料原料引起的间接排放量的认识还很少。这项研究估算了许多这类原料的间接排放量，并发现，如果将RED II的温室气体计算方法包括间接排放量核算，则目前被列为符合条件的几种途径不可能达到减少70％的温室气体排放量阈值。与以食物为基础的生物燃料类似，某些合格的原料可能根本无法节省任何温室气体。

这项研究还评估了如果将运输目标更改为减少温室气体排放的目标（类似于欧盟燃料质量指令（FQD）的目标），则该政策在2030年可以实现的总温室气体节省量。分析表明，与交付的可再生能源总量相同，与委员会提案中的能源目标相比，温室气体目标将推动更大的温室气体减排。如果包括间接排放核算，与欧盟委员会的提议相比，温室气体目标可以使RED II运输目标的温室气体节省量增加一倍以上。该分析表明，RED II中运输目标的重大变化可以使该政策在缓解气候变化方面更加有效。